Centar za istraživanje genoma u New Yorku NYGC i IBM objavili pokretanje inicijative koja za cilj ima ubrzati ostvarenje genomske medicine uporabom kognitivnog računalnog sustava IBM Watson
IBM i NYGC zajedno će testirati prototip Watson računalnog sustava, oblikovanog i konfiguriranog za istraživanje genoma. Watson treba postati alat koji će onkolozima pomoći u osmišljavanju personaliziranih načina liječenja ljudi oboljelih od raka. NYGC i partnerske medicinske ustanove planiraju ustanoviti može li im Watson pomoći u osmišljavanju potpuno individualiziranih načina liječenja pacijenata koji boluju od glioblastoma, agresivnog malignog tumora koji svake godine ubije više od 13 tisuća ljudi samo u Sjedinjenim Američkim Državama. Unatoč izvanrednim otkrićima o genetskim pokretačima raka, kao što je glioblastom, tek je nekoliko pacijenata do sada imalo koristi od personaliziranih tretmana posebno prilagođenih njihovim individualnim mutacijama raka. Liječnici do sada nisu imali ni vremena ni alate kojima bi terapije utemeljene na specifičnostima DNK primijenili na pacijentima.
Da bi to mogli, moraju povezati podatke koje prikupljaju sekvencioniranjem (čitanjem) gena s podacima iz istraživanja objavljenima u medicinskim časopisima, novim studijama i s podacima koji su pohranjeni u bolničkim evidencijama. Problem s time je što to moraju učiniti u doba u kojem se količina medicinskih podataka udvostručava svakih pet godina.
Cilj zajedničke inicijative centra NYGC i IBM-ova odjela zaduženog za razvoj Watsona je ubrzati te složene procese - prepoznati obrasce koji se pojavljuju tijekom sekvencioniranja genoma i analize medicinskih podataka kako bi došli do uvida koji će liječnicima pomoći u ostvarenju svih obećanja genomske medicine. Kombinacija stručnosti, poznavanja genetike i liječničke ekspertize ljudi u NYGC-u i računalne snage sustava IBM Watson, omogućit će daljnji razvoj i usavršavanje Watsona kao alata koji će medicinskim stručnjacima pomoći u razvoju personaliziranih načina liječenja raka.
Sustav Watson, dostupan kao usluga putem Interneta, u „oblaku", bit će konfiguriran za analizu genetskih podataka, opsežne bio-medicinske literature i baze podataka s informacijama o lijekovima. Watson će moći stalno 'učiti', scenarij po scenarij, suočavajući se sa svakim novim pacijentom i obrađujući informacije koje će mu biti dostupne iz novih medicinskih istraživanja, časopisa i kliničkih studija. Ovisno o Watsonovoj sposobnosti temeljite i brze obrade golemih baza podataka u projekt suradnje NYGC-a i IBM-a uključivat će se sve veći broj pacijenata kojima će biti propisivane terapije na temelju specifičnosti DNK molekule njihove bolesti.
Od prvog mapiranja ljudskog genoma prije više od deset godina napravili smo golem napredak u razumijevanju genetskih pokretača bolesti. Izazov pred kojim se sad nalazimo jest pronalaženje smisla u golemim količinama genetskih podataka i u njihovu 'prevođenju' u informacije koje će nam omogućiti osmišljavanje boljih načina liječenja pacijenata, izjavio je liječnik, dr. Robert Darnell, znanstveni direktor i predsjednik Centra za istraživanje genoma u New Yorku. Primjena kognitivnog računala Watson unijet će revoluciju u istraživanje genoma i ubrzati stvaranje boljih načina liječenja pacijenata sa smrtonosnim bolestima - personaliziranim terapijam.
Prva primjena Watson računala u istraživanju genoma
Watson će upotpuniti metode brzog sekvencioniranja genoma. Očekuje se da će dramatično smanjiti vrijeme koje je potrebno za usporedbu podataka koji se prikupljaju promatranjem genetskih mutacija kod pojedinog pacijenta s podacima koji se nalaze u medicinskoj literaturi, liječničkim nalazima, istraživanjima i u relevantnim terapeutskim indikacijama. Namjera je doći do što više informacija koje će liječnicima omogućiti razmatranje većeg broja terapija nego što bi to mogli samo na temelju promatranja genetskih mutacija koje uočavaju kod svojih pacijenata. Usto, Watson će pomoći znanstvenicima u centru NYGC u shvaćanju podataka do kojih dolaze putem biopsija tkiva, detaljnim sekvencioniranjem genetskih varijacija normalnih i kancerogenih tumora mozga.
Napredak u istraživanjima genoma rezultirao je dostupnošću veće količine informacija. Zato ćemo proces analize učiniti puno praktičnijim i dostupnijim, putem cloud-kognitivnih inovacija kao što je Watson, izjavio je dr. John E. Kelly III., stariji potpredsjednik i direktor IBM-ova odjela za znanstvena istraživanja, IBM Research. Nakon stjecanja novih spoznaja liječnici će moći napasti rak i ostale smrtonosne bolesti terapijama koje će biti posebno oblikovane prema profilima pacijentove DNK i profilu DNK same bolesti. Ako u tome uspijemo, bit će to veliko postignuće koje će poboljšati živote milijuna pacijenata diljem svijeta.
Cilj je od prototipne konfiguracije kognitivnog računala Watson napraviti stroj koji će asistirati liječnicima u analizi genomskih podataka tijekom kliničkih istraživanja koje provodi NYGC. Rješenje se razvijalo tijekom proteklih deset godina u IBM-ovu centru za računalnu biologiju, pri odjelu IBM Research.
IBM je član-tehnološki utemeljitelj centra NYGC i radi na unaprjeđivanju genetskih istraživanja koja se provode u toj organizaciji. Cilj je prevesti podatke koji se steknu istraživanjem genoma u klinička rješenja za liječenje ozbiljnih bolesti - suradnjom medicine, znanosti i tehnologije. Biologija u posljednje vrijeme postaje znanost koja se sve više oslanja na obradu informacija pa će analitičke metode i snažni računalni sustavi pomoći u ostvarenju njenih ciljeva i obećanja. Stručnjaci tvrtke IBM i centra NYGC, specijalizirani za računalnu biologiju, poznati su po nizu otkrića do kojih su došli primjenom analitičkog pristupa u istraživanjima i primjenom informatičkih tehnologija sljedeće generacije.
